1904年任内阁中书。1907年在北京办《京报》。191🜑🜑0年（宣统二年）办《刍言报》。著有《汪穰卿遗著》《汪穰卿笔记🚚》等。
蔡元培到京后，开始听到的消息是因为经费困难，缓派赴欧留学人员。他将给清廷学部的留德申请呈上后，便耐心等待。经多方打听，不久便搞清楚了，原来“愿赴欧美者人数太少，派送之事竟搁置不办”，蔡元培的同乡肖伯棠，缪献甫极力劝说他自🕜费留学，并慨然代为筹资。
蔡元培于是一方面应译学馆馆长章一山之聘，出任该馆国文教员。☪🂋🍏一方面向学部申🁈🃱请自费留学，等待批准。
1907年4月，清政府任命孙宝琦为驻德公使，这为蔡元培赴德提供了机会。孙宝琦的弟弟孙宝暄与🔧蔡元培是故交，由孙宝暄从中介绍，蔡元培到孙宝琦家登门拜访，求孙宝琦帮忙，在驻德使馆安排一任职，帮助他实现留德的心愿。
孙宝琦早就认💥识蔡元培，并且印象极佳。不但一口答应帮忙，为免于影响他的学习，给他安排了个虚职。除了为蔡元培去德国提供方便外🚼，实际是每月资助学费30两(合42银圆🎫🔄♮)。
与此同时，蔡元培还通过挚友张元济与上海商🌂务印书馆商洽，特约他在德国为该馆🁈🃱翻译德文著作，每月付给稿酬100银圆。这两笔收入远不能解决蔡元培在德国的费用和国内妻儿的家用，但蔡元培迫切的心情使他也顾🙣不了许多。
很快，蔡元培抛家别子，于🅑🅹6月随孙宝琦一行前往🌶🃢🙛德国，开始了他的首次欧洲之行。🎜
据统计，清末留德的中国学生前后总计有114人，其中官费生8☪🂋🍏7名，自费生27名，年龄多数不到25岁。在早期众多的🛍🛄留学生中并不乏自费生，但是，蔡元培可谓是不依赖国内支持、“半工半读”的🎂🎎🐀第一个留学生。而且当时的蔡元培已是年近四旬，年纪远远超过其他留学生。
蔡元培在🌐♻🍤德国第一年居住在柏林，由于经济拮据，生活非常艰苦，他曾以“半佣半丐之生涯”来形容自己的这段德国求学生活。
为解决在德国生活和🌆☟求学的费用，蔡元培在孙宝琦的介绍下，为时在柏林留💳学的唐绍仪之侄等四人做国学家庭教师，月薪100马克(合🚼55银圆)。
在为他人补习国学获得一定生活费用的同时，蔡元培还要请老师为自己补习德🐳语。蔡元培虽在青岛时学过德语，但远没过关。德语那生疏的文法、拗口的发音对年近四十的蔡元培来说，🆧👿🎩学习起来艰难程度可以想见。
蔡元培初到德国时🐙住在柏😋⛜林，主要补习德语，为考柏林大学作准备。
1908年暑假，蔡元培便申请就读德国最有名的柏林大学，但因不能提供中学毕业证书而无法注册入学，他只好离开柏林前往莱比锡大学。没有进入德国最有名的柏林大学当然遗憾，但莱比锡大学也属当时的尖子大学，建于1409年，是德国最古老的大学之一，拥有哲学家🖅🐌⚆和实验心理学创始人冯特和历史学家兰普来西等一批一流的学者。当蔡元培来到莱比锡大学时，正是大学500年校庆的前夕，也是莱比锡大学最为辉煌的时期，学生人数达到12000人之众。
关于这段经历，蔡元培曾自述：“我在柏林一年，每日若干时学习德语，若干时教国学，若干时为商务编书，若干时应酬同学，实苦应接不暇。德语进步甚缓，若长此🗳☆因🐬循，一无所得而归国，岂不可惜！适同学齐君宗颐持使馆介绍函向柏林大学报名，该大学非送验中学毕业证不可，遂改往来比锡（leipzig）进大学。”